廣東省微生物研究所前身為中科院中南真菌研究室，于1964年5月19日經(jīng)國家科委批準(zhǔn)成立，1972年改為現(xiàn)名，隸屬于廣東省科學(xué)院。依托研究所，1999年廣東省微生物分析檢測中心經(jīng)廣東省編辦批準(zhǔn)成立?，F(xiàn)有員工284人，在讀博士和碩士研究生48人，在站博士后7人。其中專業(yè)技術(shù)人員205人，博士55人，碩士67人。研究員27人，副研究員32人。建成由中國工程院院士、廣東省科技領(lǐng)軍人才、國家優(yōu)秀青年基金獲得者等為領(lǐng)軍科學(xué)家的六大研究中心，在微生物應(yīng)用基礎(chǔ)研究、行業(yè)共性關(guān)鍵技創(chuàng)新及科技服務(wù)、微生物高技術(shù)成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化方面，研究所己成為國內(nèi)領(lǐng)軍科研機(jī)構(gòu)。
作為具有熱帶亞熱帶區(qū)域特色與優(yōu)勢的微生物學(xué)專業(yè)科研機(jī)構(gòu)，面向國家和廣東省社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展對微生物學(xué)的重大需求，長期重點(diǎn)致力于具有熱帶亞熱帶特色的微生物資源、微生物與生態(tài)環(huán)境、食品安全及健康等相關(guān)基礎(chǔ)、應(yīng)用基礎(chǔ)及公益性研究，開展為支撐生物技術(shù)相關(guān)行業(yè)可持續(xù)發(fā)展的共性關(guān)鍵技術(shù)研究及儲備性前沿技術(shù)探索。所內(nèi)建成了省部共建華南應(yīng)用微生物國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國家廣州化學(xué)品生態(tài)環(huán)境安全評價(jià)服務(wù)中心、國家生物產(chǎn)業(yè)基地公共實(shí)驗(yàn)中心、國家專利菌種保藏機(jī)構(gòu)—廣東省微生物菌種保藏中心、華南地區(qū)最大（全國第二大）的大型真菌標(biāo)本館、廣東省飲用水安全應(yīng)急技術(shù)研究中心等一大批國家和省部級科技創(chuàng)新平臺。目前研究所已形成資源微生物學(xué)、環(huán)境微生物學(xué)、分析微生物學(xué)和霉腐微生物學(xué)等四大國內(nèi)優(yōu)勢學(xué)科。具有博士研究生和碩士研究生培養(yǎng)能力，建成兩個由國家人力資源和社會保障部批準(zhǔn)的博士后科研工作站。廣東省微生物學(xué)會、廣東省食用菌行業(yè)協(xié)會、廣東省生物技術(shù)生產(chǎn)力促進(jìn)中心、廣東省質(zhì)量監(jiān)督食用菌檢驗(yàn)站均掛靠該所。同時兼任中國食用菌協(xié)會副會長單位。
建所五十多年來，研究所在科技創(chuàng)新、行業(yè)共性關(guān)鍵技術(shù)及科技服務(wù)和科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化等方面取得了顯著成績。在科技創(chuàng)新方面，先后承擔(dān)了國家“973”計(jì)劃、國家“863”計(jì)劃、國家重大科技攻關(guān)、國家科技支撐、國際合作、國家自然科學(xué)基金、農(nóng)業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化、國家生物高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化示范工程、廣東省教育部產(chǎn)學(xué)研、粵港招標(biāo)項(xiàng)目和省基金團(tuán)隊(duì)、省重大重點(diǎn)科技攻關(guān)以及科技援藏、廣州市重大重點(diǎn)科技項(xiàng)目等重大重點(diǎn)科技項(xiàng)目。共取得科技創(chuàng)新成果152項(xiàng)，其中國際先進(jìn)、領(lǐng)先水平的76項(xiàng)；獲得國家及省部級成果獎111項(xiàng)，其中國家級成果獎7項(xiàng)、省部級一等獎16項(xiàng)；共申請專利365件，授權(quán)專利209件，其中發(fā)明專利195件。2010年被認(rèn)定為“廣東省知識產(chǎn)權(quán)示范事業(yè)單位”和“全國企事業(yè)知識產(chǎn)權(quán)試點(diǎn)單位”；主持和參與國家、行業(yè)和地方標(biāo)準(zhǔn)的制修訂110多個；在國內(nèi)外核心學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文2000多篇，出版科技專著36部。獲“十一·五”國家科技計(jì)劃執(zhí)行優(yōu)秀團(tuán)隊(duì)獎。
依托于該所建設(shè)的廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在2000年、2003年、2006年和2010年連續(xù)四次被評為廣東省優(yōu)秀重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室2008年以優(yōu)異成績通過廣東省科技廳的驗(yàn)收；在廣東省菌種保藏與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣東省微生物應(yīng)用新技術(shù)公共實(shí)驗(yàn)室的基礎(chǔ)上組建的廣東省華南應(yīng)用微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2009年獲科技部批準(zhǔn)組建省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地，2012年4月通過科技部組織的專家驗(yàn)收，2013年3月通過科技部組織的專家論證，成功晉升為省部共建華南應(yīng)用微生物國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的主要研究方向?yàn)?ldquo;熱帶亞熱帶微生物資源多樣性與利用、環(huán)境微生物與區(qū)域生態(tài)安全、有害微生物監(jiān)測與防控”。目前實(shí)驗(yàn)室擁有實(shí)驗(yàn)面積6750平方米，包括公共實(shí)驗(yàn)室、大型儀器室、華南微生物資源中心（包括標(biāo)本庫和菌種保藏中心）、環(huán)境微生物實(shí)驗(yàn)室、微生物檢測與控制實(shí)驗(yàn)室、霉腐微生物實(shí)驗(yàn)室、食藥用菌生理功能及分子機(jī)理實(shí)驗(yàn)室、工業(yè)化前期實(shí)驗(yàn)室及動物實(shí)驗(yàn)技術(shù)公共服務(wù)平臺等；擁有10萬元以上各類儀器設(shè)備127臺套，原值5338萬元，其中30萬元以上設(shè)備49臺套，包括流式細(xì)胞儀、透射電子顯微鏡、掃描電子顯微鏡、激光共聚焦顯微鏡、原子力顯微鏡、分子相互作用儀、高通量基因測序儀、數(shù)字PCR系統(tǒng)、超高效液相色譜儀、微生物電解呼吸儀、質(zhì)譜聯(lián)用儀、氣相色譜儀、電感耦合等離子體質(zhì)譜儀、高性能三重串聯(lián)四級桿液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)、高速冷凍離心機(jī)、全自動微生物鑒定系統(tǒng)等，以上設(shè)備大部分是2008年以來購置，整體儀器設(shè)備達(dá)到國際先進(jìn)水平，以上實(shí)驗(yàn)室及設(shè)備完全具備了分子水平、細(xì)胞水平及基因水平的研究要求。
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