春栽袋料香菇菌棒生產(chǎn)時間雖然選擇平均氣溫低于10℃～15℃以下低溫季節(jié)，仍然不能保障100%成品率，必須經(jīng)過各種各樣的無菌化工藝控制措施減少污染率，促使和保障成品率的提高。因此，工廠化制袋過程的污染率控制是制棒廠常態(tài)化管理技術(shù)。在實際生產(chǎn)中的污染率控制在5%以下，對投入產(chǎn)出和效益沒有太大影響，而大于10%甚至超過20%以上的污染率，不僅對菌棒越夏管理和出菇管理增加管控難度，還會對出菇產(chǎn)量和投資效益產(chǎn)生嚴重影響甚至虧損。
目前袋料香菇菌棒生產(chǎn)成本隨著人工費用和栽培設施化成本的增加，香菇菌棒的生產(chǎn)成本與出菇效益的利潤空間越來越小，尤其是木屑原料過大引起的微孔率超過10%以上，加上開放式接種的可見性污染率超過20%左右的習慣性污染率模糊控制，到了不可忽視的程度。特別是菌棒攜帶了不可見雜菌之后，不僅容易出現(xiàn)燒菌、腐軟壞棒或出菇稀少、菇小、容易開傘等異常現(xiàn)象，而且會大幅度減產(chǎn)，所以20%的污染率不僅是增加20%左右的生產(chǎn)成本，甚至因為污染菌棒對出菇產(chǎn)量產(chǎn)生大于30%以上的減產(chǎn)幅度，直接影響到工廠化生產(chǎn)的出菇產(chǎn)量和效益。此類現(xiàn)象是導致行業(yè)默認的工廠化生產(chǎn)（配方質(zhì)量、品種選配、污染率控制、出菇潮次和規(guī)范化管理等）賺錢難的幾個重要因素之一。
規(guī)?；a(chǎn)的春栽香菇菌棒轉(zhuǎn)色過程，是在越夏菇棚中靜止擺放，利用遮陰棚里20℃左右自然氣溫完成自由轉(zhuǎn)色，并且利用刺孔機刺孔的60個左右孔眼，自由排放轉(zhuǎn)色期間分泌的液體。然而，因為規(guī)?；a(chǎn)的菌棒數(shù)量過多，不僅減少了5～6次的頻繁刺孔發(fā)菌管理程序為2～3次，而且省去了轉(zhuǎn)色過程的手工翻垛和轉(zhuǎn)袋排出轉(zhuǎn)色積水的發(fā)菌管理程序。但因為栽培規(guī)模的成本擴展，箱式接種普遍轉(zhuǎn)向塑料大棚開放式接種，增加了開放式接種的污染系數(shù)和人為造成的不可見雜菌的污染機率，讓菌棒出現(xiàn)燒堆或腐軟現(xiàn)象成為常見問題。
防治措施：
1.減少刺孔翻堆次數(shù)的同時也減少了感染機率。因為頻繁的翻堆刺孔，無疑增加了感染機率，也增加了勞動強度和管理成本。因此，翻堆刺孔的次數(shù)只有兩次翻堆刺孔和第三次刺孔轉(zhuǎn)色并直接上架越夏的工序。
2.增加越夏菇棚的遮光降溫通風效果。一是提高越夏菇棚的高度，二是增加雙層黑網(wǎng)的遮陽密度，三是提高越夏菇棚的井水降溫管理條件，四是嚴格越夏菇棚的通風和溫度管控。
3.對選出的染雜菌棒和帶病菌棒采取下架管理。因為木屑木片超大，微孔率增加和開放式接種的污染率增加等原因，菌棒污染率和帶病菌棒的比例普遍大于10%甚至超過30%，此類菌棒需要保持在低溫環(huán)境安全越夏，所以對此類菌棒全部采取下架管理，擺放到越夏菇棚的地面上，輕度病棒直立到地面、重度病棒平放地面度過夏季。并對6層架以上不放菌棒，下架到5層以下，防止持續(xù)高溫對越夏菇棚頂部積溫，引發(fā)高溫燒菌危險。
4.對越夏菇棚采取自動化感觀降溫管理。一是采取放大氣的菌棒進入越夏菇棚一部定位，不允許越夏過程翻動菌棒，減少摩擦碰撞或移動引起的損傷性壞棒或腐軟現(xiàn)象。二是在菇棚安裝超溫警示和自動噴淋降溫裝置，增加檢測越夏菇棚溫控管理的靈敏度。三是參考天氣形勢預報，采取“保持手感菌棒涼爽”管理，出現(xiàn)手感菌棒溫熱感或自然氣溫超過35℃必須噴淋降溫，對越夏菇棚加強溫度調(diào)控和通風管理。
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